La Secretaría de las Mujeres es una institución comprometida con la Igualdad Sustantiva entre mujeres y hombres. Por eso, el Gobierno Constitucional de Oaxaca ha decidido que la Perspectiva de Género sea un eje transversal en las políticas públicas y programas que promueve, para superar la desigualdad y la discriminación histórica de que han sido objeto las mujeres en el Estado.
Para el Gobierno de Oaxaca, la Igualdad de Género implica reconocer que las diferencias de acceso a recursos, formación de capacidades, reconocimientos y poder entre mujeres y hombres, derivan en un posicionamiento estructural desventajoso para las primeras; en función de esto, deben definirse políticas que modifiquen este desbalance de poder.