Với tiền thân là Công ty Giống cây trồng phía Nam - được thành lập năm 1976, qua quá trình hình thành và phát triển, đến năm 2002 được cổ phần hóa và đổi tên thành Công ty Cổ phần Giống cây trồng miền Nam với vốn điều lệ ban đầu là 60 tỷ. Hiện nay vốn điều lệ là 150 tỷ đồng.
Công ty Cổ phần Giống cây trồng miền Nam là công ty chuyên nghiên cứu, sản xuất, kinh doanh các loại hạt giống cây trồng và vật tư nông nghiệp.