מכון מורשת אבות עוסק בלימוד והדרכה במקצועות הקודש כדוגמת שחיטה, מילה, ספרות סת"ם וכד', בארץ ובחו"ל.
כמו כן המכון עוסק בפיתוח ושימור המסורת המוזיקלית של יהדות מרוקו המעטירה, וזאת באמצעות התזמורת האנדלוסית מורשת אבות בראשותו של ראש המכון הרב מרדכי עזרן שליט"א. התזמורת מקיימים ערבי שירה ופיוט במסגרת שבתות הבקשות המסרתיות, בליווי מוזקלי מלא, ומופעי פולקלור בהשתתפות מיטב האמנים בתחום.