החוג למוסיקולוגיה באוניברסיטה העברית נוסד בשנת 1965 על-ידי אלכסנדר רינגר ז"ל מאוניברסיטת אורבנה-שמפיין אשר בארצות-הברית.
היה זה החוג הראשון למוסיקולוגיה בארץ, ועם סגל מוריו נימנו כבר במהלך העשור הראשון לקיומו כמה מבכירי המוסיקולוגים בארץ ובעולם:ישראל אדלר ז"ל, בתייה באייר ז"ל, יהואש הירשברג , דון הרן, יוסף טל ז"ל, דליה כהן, רות כץ ואמנון שילוח.
כמו אז, גם היום חוקרים בחוג ומלמדים מוסיקה על כל היבטיה תוך שימת דגש על ההקשרים המקומיים, הגלובליים ועל רב תחומיות.
החוג מציע מגוון של קורסים בשלוש מגמות התמחות עיקריות: היסטוריה שלהמוסיקה במערב, אתנומוסיקולוגיה ותיאוריה מוסיקלית.
בין מורי החוג מומחים למרבית התקופות במוסיקה המערבית, מימי הביניים ועד ימינו, כולל אופרה ודרמה מוסיקלית, כמו גם למוסיקה יהודית, ישראלית וחוץ-מערבית, לפסיכו-אקוסטיקה ולקוגניציה, לקונטרפונט ולהרמוניה, לאסתטיקה, לסמיוטיקה מוסיקלית, למוסיקה בזיקותיה לאמנויות אחרות ולביקורת תרבות.
נוסף על המורשת המוסיקלית הקאנונית, מוקנה לתלמידים ידע במוסיקה בת זמננו, מוסיקה פופולארית (כולל ג'אז), מוסיקה ומחשבים ועוד.