A inicios de 1945, Hitler nombra a Wilhelm Monhke como comandante de la defensa del Distrito Gubernamental de Berlín (apodado Die Zitadelle, La ciudadela), que incluía la Cancillería y el Führerbunker.

El puesto de mando de Mohnke estaba dentro de los búnkeres situados debajo de la Cancillería, como se ve en esta escena.

Él formó el Kampfgruppe Mohnke, que estaba compuesto por dos regimientos debilitados. Se formó a partir de la compañía antiaérea de la Liebstandarte, tropas de reemplazo del Ausbildungs-und Ersatz Battalion de la Leibstandarte de Spreenhagen al mando del SS-Standartenführer Anhalt, 600 hombres del Begleit-Bataillon Reichsführer-SS, la Führer-Begleit-Kompanie y el núcleo del grupo eran 800 hombres del Batallón de Guardia de la Leibstandarte (asignados a proteger a Hitler).

Aunque Hitler había nombrado al General Helmuth Weidling comandante de la defensa de Berlín, Mohnke quedó libre de las órdenes de Weidling para mantener la defensa de la Cancillería y el Führerbunker.

El 30 de abril, después que Otto Günsche le dio la noticia del suicidio de Hitler, Mohnke participó en una conferencia donde se aplicaron las anteriores órdenes, según las cuales aquellos que estaban en condiciones podían huir del cerco del Ejército Rojo.
El plan era escapar de Berlín en dirección a los Aliados en la orilla occidental del Elba, o en dirección al Ejército alemán en el norte. Antes de la huida, Mohnke informó a todos los comandantes (que pudo contactar) en el sector de la Zitadelle sobre los eventos de la muerte de Hitler y la planificada huida.
El 1 de mayo de 1945, ellos se dividieron en diez grupos principales.
El grupo de Mohnke incluía a las secretarias Traudl Junge, Gerda Christian, Else Krüger, la dietista nutricionista de Hitler Constanze Manziarly, Ernst-Günther Schenck, Walther Hewel y otros más.

El grupo avanzó a lo largo de los rieles del metro, pero su ruta estaba bloqueada y volvieron a salir a la calle, uniéndose más tarde a cientos de civiles y soldados alemanes que se habían refugiado en la Cervecería Schultheiss-Patzenhofer de Prinzenallee.

Sabiendo que no podría atravesar el cerco soviético, Mohnke decidió rendirse ante el Ejército Rojo. Sin embargo, varias personas del grupo de Monhke (incluyendo algunos miembros del SS) decidieron suicidarse.

Mohnke trabajó después de la guerra como representante de ventas de una concesionaria de camiones en Barsbüttel. Murió en la aldea costera de Damp, el 6 de agosto de 2001, a la edad de 90 años.